中国社会科学院经济研究所的前身是1929年成立的中华教育文化基金会社会调查所。1934年社会调查所与中央研究院社会科学研究所合并，沿用社会科学研究所名称。1945年更名为中央研究院社会研究所。1949年新中国成立后，改称中国科学院社会研究所。1953年更名为中国科学院经济研究所，1977年始沿用现名。现在经济研究所已发展成为一个理论经济学、应用经济学和经济史学（包括经济史和经济思想史）三方面兼有，而以基本理论研究为主的综合性经济研究机构。编辑出版学术杂志《经济研究》、《经济学动态》、《中国经济史研究》。

　　按照国务院学位办的学科划分标准，经济系具有理论经济学一级学科博士学位授予权。博士招生范围包括政治经济学、经济思想史、经济史、西方经济学、发展经济学5个二级学科，硕士招生范围包括政治经济学、经济思想史、经济史、西方经济学、发展经济学，以及应用经济学学科的国民经济学6个二级学科。

　　经济系目前有博士生导师36名，硕士生导师44名；学部委员3人。现任经济系主任为经济研究所副所长、博士生导师朱恒鹏研究员。